由浙江海洋學(xué)院,、上海交通大學(xué),、復(fù)旦大學(xué)等高校研究機(jī)構(gòu)聯(lián)合破譯的大黃魚(yú)全基因組圖譜,,日前在世界權(quán)威期刊――《自然》周刊發(fā)表。這是繼半滑舌鰨之后,,我國(guó)公布的第二個(gè)海水魚(yú)類(lèi)的基因組圖譜,也是世界上第一個(gè)石首科魚(yú)類(lèi)基因組圖譜,,標(biāo)志著我國(guó)海洋生物學(xué)的研究真正進(jìn)入基因組時(shí)代,。
自1985年大黃魚(yú)人工養(yǎng)殖取得成功以來(lái),大黃魚(yú)成為我國(guó)網(wǎng)箱養(yǎng)殖產(chǎn)量最高的海水經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi),。但隨著養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的進(jìn)一步發(fā)展,,人工養(yǎng)殖大黃魚(yú)遺傳多樣性降低、抗病能力減弱的問(wèn)題日益成為困擾大黃魚(yú)養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要瓶頸,。
“養(yǎng)殖大黃魚(yú)抗病能力差,是不是可能與其免疫系統(tǒng)的特定基因組及其特定進(jìn)化模式有關(guān)聯(lián),?”浙江海洋學(xué)院吳常文教授等科研團(tuán)隊(duì)成員基于這樣的懷疑,,于2010年以來(lái)展開(kāi)專(zhuān)題研究,2012年,,《基于全基因組信息的魚(yú)類(lèi)遺傳育種》項(xiàng)目列入國(guó)家863計(jì)劃項(xiàng)目,。科研人員試圖通過(guò)大黃魚(yú)基因組測(cè)序,、基因注釋?zhuān)馕龃簏S魚(yú)抗病性狀的遺傳基礎(chǔ),,為大黃魚(yú)抗病力的遺傳解析和抗病力強(qiáng)的優(yōu)良品系培育奠定了基礎(chǔ)。
科研人員發(fā)現(xiàn),,繪制出基因序列圖譜的大黃魚(yú)基因組,,包含48條染色體,比人類(lèi)還多兩條,,全基因組大小在750米左右,,相當(dāng)于人類(lèi)的1/4。
以往包括大黃魚(yú)在內(nèi)的硬骨魚(yú)免疫基因功能的研究發(fā)現(xiàn),,大黃魚(yú)存在一些重要的先天免疫基因,,這些基因被海洋病原菌感染后,在魚(yú)體內(nèi)的表達(dá)將嚴(yán)重下調(diào),??蒲袌F(tuán)隊(duì)對(duì)大黃魚(yú)進(jìn)行了高深度全基因測(cè)序、從頭組裝和分析,,發(fā)現(xiàn)大黃魚(yú)具有發(fā)育良好的先天免疫系統(tǒng),,形成了一套獨(dú)特的免疫模式,部分基因在大黃魚(yú)先天性免疫方面起到了重要作用,。
這一研究展示了令人興奮的應(yīng)用前景,,研究團(tuán)隊(duì)下一步將重點(diǎn)研究挖掘其他更多的免疫基因,闡明它們?cè)诿庖咧械淖饔?,解析它們?cè)诳共×Τ尸F(xiàn)中的權(quán)重,,進(jìn)而檢測(cè)野生大黃魚(yú)和養(yǎng)殖大黃魚(yú)的免疫基因組成差異,。
研究人員表示,通過(guò)大黃魚(yú)免疫基因位點(diǎn)優(yōu)良等位基因的聚合和選育,,將有望培育出先天免疫能力強(qiáng),、抗病力高的大黃魚(yú)抗病品系,解決養(yǎng)殖過(guò)程中大黃魚(yú)病害頻發(fā)的瓶頸問(wèn)題,。除此之外,,研究團(tuán)隊(duì)將通過(guò)基因組信息的挖掘,發(fā)現(xiàn)更多與大黃魚(yú)生長(zhǎng),、抗逆,、性成熟等生產(chǎn)性狀有關(guān)的基因,全面提高養(yǎng)殖大黃魚(yú)生產(chǎn)性能,,促進(jìn)大黃魚(yú)增養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,。
據(jù)介紹,《自然》周刊所刊載的內(nèi)容涵蓋了自然科學(xué)各個(gè)研究領(lǐng)域,,尤其在生物學(xué),、醫(yī)學(xué)、物理學(xué)等領(lǐng)域卓有成就,。許多新的發(fā)現(xiàn),、創(chuàng)新性的文獻(xiàn)大多首發(fā)于《自然》周刊。我國(guó)每年公布的世界十大科技新聞,,也大多來(lái)源于《自然》周刊,。