乳腺中的活性雙能干細胞

 

哺乳動物乳腺中雙能干細胞和單能干細胞各自所起作用是當前很多研究工作的一個重點。Jane Visvader及同事開發(fā)出一個三維成像方法，它與一個“隨機多色reporter”一起使用，使研究人員能夠在克隆層面上進行世系追蹤和對整個輸乳管進行活體細胞追蹤。本文作者采用這一方法發(fā)現(xiàn)，雙能乳腺干細胞在青春期乳腺形態(tài)發(fā)生中和在其長期維持中都起核心作用。他們還在原位識別出了在輸乳管擴大中起顯著作用的長壽命管腔祖細胞。

 

白血病癌變之前的過程

 

人們認為幾乎所有癌癥都是克隆的――是某一個突變的細胞的后代，但從第一個突變到很多不同形式癌癥的演化通道在很大程度上仍不知道。John Dick及同事研究了來自“急性髓性白血病”（AML）患者的周圍血液和骨髓樣本，并在很大比例的患者中識別出了同時有DNMT3Amut 和NPM1c 突變的白血病細胞。這些患者還有攜帶DNMT3Amut，但不帶NPM1c的白血病前期造血干細胞。這些細胞保持了產生不同細胞類型的能力，因而具有正常造血功能，但相對于野生型造血干細胞在再增殖方面有一個競爭優(yōu)勢，在經過化療、病情減輕之后能持久存在，因此可能充當一個庫的作用，讓進一步的突變和對治療的抵抗力能夠積累。這項工作表明DNMT3和其他基因中產生白血病前期造血干細胞的突變是可能的藥物作用目標，并且說明白血病前期克隆的識別和處理也許可幫助消除對治療的抵抗力。

 

RNA-蛋白復合物的組織方式

 

蛋白-RNA復合物的組裝會涉及RNA結構的雕刻，因為蛋白是按順序被結合在一起的，但對這些變化的詳細情況的直接演示一直有困難。Sarah Woodson及同事采用先進的三色“熒光共振能量轉移”（FRET）和模擬方法來研究在30S核糖體的組裝中早期發(fā)生的事件。他們發(fā)現(xiàn)，當S4核糖體蛋白與16S rRNA發(fā)生相互作用時，存在一個穩(wěn)定的、on-path、non-native中間體；而且該S4蛋白還能改變RNA螺旋動態(tài)，以幫助發(fā)生使隨后的蛋白結合成為可能的構形變化。

 

關于宮頸癌的一項全基因組篩查

 

為了給造成宮頸癌的基因組異常提供一個概覽，本文作者對115對“宮頸癌―正常人”、79個宮頸癌樣本的轉錄組序列和來自14對“宮頸癌―正常人”的全基因組進行了全外顯子組測序和分析。這些分析將MAPK1、HLA-B 和ELF3 識別為新的嚴重突變的基因，并且提供了證明“人乳頭瘤病毒”（HPV）的整合是宮頸癌中目標基因過度表達的一個普遍機制的證據。這些結果還為鱗狀細胞癌和腺癌的突變情況提供了一個對比。

 

風濕性關節(jié)炎的藥物目標

 

在一項對超過10萬名歐洲裔和亞洲裔人士進行的“全基因組關聯(lián)研究”（GWAS）元分析中所做的虛擬篩選，顯示了風濕性關節(jié)炎（RA）的42個以前不知道的風險位點。作為這項研究的一個后續(xù)工作，本文作者建立了一個新的電腦模擬管道，從而在所有已知的RA風險位點上識別出98個生物候選基因。他們發(fā)現(xiàn)這些基因是已獲批準的RA治療藥物的作用目標，并且進而提出，獲準用于其他疾病的藥物也許可以重新考慮用于RA的治療。

 

一種Tet-樣蛋白的結構

 

Tet家族的加雙氧酶將5-甲基胞嘧啶（5mC）轉化成5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）、5-甲酰基胞嘧啶（5fC）和5-羧基胞嘧啶（5caC）。在這項研究中，Xiaodong Cheng及同事從結構上和生化上定性了來自阿米巴鞭毛體Naegleria gruberi的Tet-樣蛋白。Naegleria Tet-樣蛋白（NgTet1）與哺乳動物Tet蛋白的序列相似性大約為39%，同時也具有相似的生化活性。與含有一個甲基化的CpG點的DNA形成復合物的NgTet1的晶體結構顯示，NgTet1利用一個堿基翻轉機制來接觸5mC。

 

Cassiopeia A：一次非對稱爆炸的殘留體

 

對恒星核心坍縮事件的大多數(shù)模擬都表明，這些爆炸是非對稱的，但所導致的形狀在不同模型中則有所不同。Brian Grefenstette等人分析了Cassiopeia A（一個年輕的核心坍縮殘留體）中放射性鈦-44的分布，將其作為爆炸非對稱性的一個代理指標。他們報告，Cassiopeia A的無激波內部的非均勻分布程度要大于從一次球形爆炸所預期的程度，但也沒有按照一次高度雙極爆炸所預期的那么顯著。根據這些發(fā)現(xiàn)，本文作者得出結論認為，Cassiopeia A核心坍縮爆炸這種爆炸類型介于非對稱性的兩個極端之間。